Manastirea Comana a fost ctitorita de domnitorul Vlad Tepes in 1461 ca o manastire-cetate, pe o insula in mlastini, la care se ajungea trecand peste un podet de lemn.Realizata initial din lemn, aceasta a ajuns o ruina si a fost refacuta in 1588 de catre Radu Serban. Manastirea avea fundatii de caramida si partea superioara din lemn. Se presupune ca aici a fost inmormantat Vlad Tepes.
Radu Serban reconstruieste manastirea pe ruinele celei vechi, iar in 1609, dupa ce devine domnitor, zugraveste biserica.
Dupa anul 1640, Manastirea Comana trece in seama Cantacuzinilor si biserica, ctitorie domneasca, devine locul de inmormantare a acestora.
Datorita bogatiei mosiilor detinute, Manastirea Comana a fost, in timpul lui Matei Basarab, unul dintre cele mai mari centre religioase din tara.